La historia de Nerja abarca milenios, comenzando con la famosa Cueva de Nerja, que alberga pinturas de focas de hace 42,000 años—uno de los primeros ejemplos conocidos de arte humano—y asentamientos de hace unos 20,000 años. Con la llegada de los romanos alrededor del año 210 a.C., se fundaron tres pueblos en la parte oriental de Málaga, incluyendo 'Detunda' (Maro), donde se han descubierto numerosos restos romanos. La conquista árabe en 711 moldeó la identidad de Nerja, nombrándola 'Narixa', que significa 'fuente de abundancia' durante la revolución cultural de Al-Andalus.
En 1487, Nerja se rindió a la invasión de los ejércitos cristianos. Tras un período de coexistencia y abusos constantes, estalló una rebelión que resultó en la huida de moriscos y judíos. El temor a los ataques piratas dificultó el crecimiento, llevando a la construcción de torres defensivas a lo largo de la costa, muchas de las cuales aún se mantienen en pie. La construcción de edificios religiosos cristianos comenzó poco después, destacando las iglesias de Nerja y Maro, como la iglesia de El Salvador (1697) y la capilla de Las Angustias (1720). El siglo XVII marcó una época dorada con la construcción de carreteras y una población de 8,000 habitantes, mejorando la infraestructura con calles pavimentadas de piedra. Desde 1950, el auge del turismo y el descubrimiento de sus cuevas han impulsado un crecimiento significativo.
